Behandlingen varer vanligvis hele livet, men enkelte pasienter kan bli kvitt sykdommen ved livsstilsendring. Dette kan eventuelt undersøkes ved ny polygrafiundersøkelse. Vellykket CPAP-behandling er avhengig av at utstyret blir brukt minst 5 - 6 timer hver natt.
En mindre andel av pasienter med obstruktiv søvnapné (OSA) har i tillegg hypoventilasjon om natten. Hypoventilasjon betyr at du puster for svakt i forhold til kroppens behov, og dette forekommer særlig hos pasienter med betydelig overvekt. Tilstanden kalles da adipositas hypoventilasjonssyndrom. Legen avdekker tilstanden ved å analysere nivået av karbondioksid i blodprøve. Dette blir behandlet enten med CPAP eller BIPAP (bilevel positive airway pressure). BIPAP er en mer avansert maskin som leverer luftstrøm til masken i to trykknivå- et noe høyere blåsetrykk i innpustfasen enn i forhold til i utpustsfasen.
BIPAP brukes også hos pasienter med sentral søvnapné (CSA).